在牡蛎肽生产工艺中的灭菌水解环节将温度降至所需要的酶解温度，选取适合的酶进行配置，并调节原液的PH值，投入适应的酶配置液，保证酶解的时间，温度和PH值，酶解结束，进行灭酶处理，获得含有小分子肽其丰富的化学物质的水解液。在过滤提纯环节中获得的水解液中不仅含有牡蛎肽，还含有其它化学物质，需要通过过滤的方法进行提纯，一般选用硅藻土或活性炭进行吸附，可以吸附住原液中的大分子物质，然后进行膜过滤，去除原液中的小分子物质，多次过滤可以提高原液的纯度及质量。